티스토리 뷰

Dev.../의료정보

genome viewer - IGV ( Integrative Genomics Viewer )

꿈꾸는자의 생각의파편들 2013.04.11 13:05

http://www.broadinstitute.org/igv/home


현재 버전이 IGV 2.2 까지 진행되고 있는 게놈 뷰어이다.

Genome의 경우 데이터를 시각화 하는 것이 매우 중요하며, 데이터의 크기나 다양성, 그리고. 직관적인 사용자의 경험을 부여하는 것은 매우 중요한 것이다.

어레이 기반의 NGS의 데이터를 모두 지원하고. 임상 표현형 데이터의 통합, 게놈 연구의 통합 성격에 초점을 맞추고 있다. 단편적으로는 해당 정보들을 고속으로 병렬처리하는 고속화도구도 필요한 상황이다.

Genome을 어떻게 시각화 할것이고, 어떻게 탐구할 것인가에 대해서 연구자에게 제공되는 것이다.

개인적으로 관심이 가는 것은... Genome의 전문적이 판독의(?)가 어떤 식으로 정보를 볼것이고, 해당 정보들중에 중요한 정보들을 어떻게 표시하고, 해당 주치의에게 전달되거나, 동료인 게놈 판독의와 협력작업을 취할 것인가가 화두이다.

현재는 GNU LGPL 오픈 소스 라이브러리로 구축되어있다.

댓글
댓글쓰기 폼